Le système immunitaire inné du tractus digestif joue un rôle primordial dans la défense contre les infections par des bactéries pathogènes retrouvées dans l’alimentation comme par exemple les Salmonelles. Une population de macrophages qui exprime le récepteur à la fractalkine, le CX3CR1, est plus particulièrement impliquée dans le rôle de défense car ces macrophages sont capables de distinguer les bactéries non-pathogènes des bactéries pathogènes et induire respectivement des réponses de tolérance ou des réponses pro-inflammatoires de défense.
S.boulardii CNCM I-745 est une levure probiotique administrée pour combattre les infections.
Les travaux de l’équipe Ecosystèmes et Immunité, publiés dans Frontiers in Immunology démontrent que cette levure module la réponse immunitaire innée au début de l'infection en favorisant les réponses pro-inflammatoires de défense. Ce mécanisme qui implique un effet immuno-modulateur de cette levure explique en partie l’effet protecteur de cette levure vis à vis des infections bactériennes du tube digestif.