Éclairer la conservation des récifs coralliens par des approches métabolomiques
Les récifs coralliens, confrontés à des pressions anthropiques sans précédent et à un avenir très incertain en raison des changements climatiques, nécessitent des options de gestion diversifiées afin de maintenir un fonctionnement sain et des services écosystémiques. Plus d'une décennie de recherches novatrices dans le domaine de la génomique des récifs a permis de mettre au point des techniques moléculaires permettant de développer des outils de gestion des récifs coralliens. En revanche, les techniques analytiques axées sur l’analyse des métabolites et leurs éléments constitutifs - qui se sont avérés très instructifs comme outils de conservation et de restauration des écosystèmes marins et terrestres - restent largement inappliquées dans le contexte des récifs coralliens. Ces métabolites sont des composés organiques intermédiaires ou issus du métabolisme. On réserve ce terme en général aux petites molécules comme le glucose.
Cette étude explore l'état actuel de la recherche sur les récifs coralliens dans les disciplines basées sur le métabolisme, couvrant la métabolomique classique (étude des métabolites), la lipidomique (étude des lipides) et la volatilomique (étude des produits volatils), et discute de leur potentiel pour la conservation des récifs. Nous suggérons que les approches basées sur la métabolomique peuvent être mises en œuvre dans le cadre de la conservation des récifs coralliens en s'appuyant sur les principes sans faille tirés de la génomique des récifs et en établissant une feuille de route des mesures à prendre pour faire progresser ce domaine : (1) maximiser la capacité de la communauté de recherche, (2) veiller à ce que les disciplines fondées sur la métabolomique soient elles-mêmes développées collectivement afin de permettre une plus grande applicabilité, et (3) développer ces disciplines parallèlement aux outils (matériels) nécessaires à la prise de décision en matière de gestion.
Publication :
Lawson C. A., Camp E., Davy S. K., Ferrier-Pagès C., Matthews J., Suggett D. J. Informing Coral Reef Conservation Through Metabolomic Approaches. In M. J. H. van Oppen, M. Aranda Lastra (eds.), Coral Reef Conservation and Restoration in the Omics Age, Coral Reefs of the World, Vol. 15, https://doi.org/10.1007/978-3-031-07055-6_12
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Dr Christine Ferrier-Pagès
