Les coraux scléractiniaires, bâtisseurs de récifs coralliens, vivent en symbiose avec des Dinoflagellés photosynthétiques. Les Dinoflagellés sont essentiels à la survie du corail car ils transfèrent à l’animal la majeure partie de leurs photosynthétats pour sa propre nutrition. Lors de stress environnementaux, comme un réchauffement anormal des eaux récifales, les coraux blanchissent, c’est-à-dire qu’ils perdent leurs Dinoflagellés photosynthétiques, qui donne généralement aux coraux leur couleur brune. Visuellement, le tissu animal devient transparent, laissant apparaître le squelette calcaire blanc. Le blanchissement n’est pas sans conséquence pour la vie des coraux, car il affecte leur capacité à se nourrir, leur croissance et leur reproduction. Si la symbiose n’est pas restaurée, alors le blanchissement conduit à la mort du corail.
Par conséquent, de nombreuses expériences sont réalisées de par le monde pour comprendre les processus impliqués dans le blanchissement corallien, ainsi que pour mieux appréhender la résistance des différentes espèces de coraux au blanchissement. Pour chaque expérience, les coraux sont collectés, préservés et archivés pour répondre à une mesure précise, et ne peuvent donc pas être ré-utilisés ultérieurement pour des mesures dans d’autres disciplines. Ceci conduit les chercheurs à continuellement refaire des expériences identiques, à chaque fois qu’une nouvelle mesure est jugée nécessaire. Ainsi, la recherche dans ce domaine fait face à des efforts redondants, à une perte de temps et à une augmentation générale des coûts.
Un récent atelier sponsorisé par la National Science Foundation a eu pour but d’établir des protocoles communs à toutes les analyses pour que les échantillons de coraux collectés dans une expérience pour une mesure donnée puissent également être utilisés pour réaliser d’autres mesures ultérieures. Les résultats de cet atelier sont publiés dans cet article, qui propose un guide méthodologique en quelques étapes simples pour la collecte, la préservation et l'archivage des coraux, afin de permettre des analyses supplémentaires et des découvertes futures grâce à la collaboration.
Les résultats des discussions montrent que la congélation rapide des échantillons dans de l'azote liquide ou leur conservation entre -80°C et -20°C est optimale pour la plupart des études omiques et physiologiques, à quelques exceptions près. Malheureusement, la congélation des échantillons supprime le potentiel de nombreuses analyses basées sur la microscopie et l'imagerie en raison de l'altération de l'intégrité des tissus pendant la congélation. Pour la microscopie et l'imagerie, les échantillons sont mieux conservés dans des aldéhydes. L'utilisation de gants et de récipients stériles pendant le prélèvement favorise l'analyse en aval des communautés bactériennes et virales associées à l'hôte, qui sont particulièrement importantes pour les efforts de lutte contre les maladies et pour les programmes de restauration. Dans toutes les disciplines, l'utilisation de techniques aseptiques pendant la collecte, la conservation et l'archivage maximise le potentiel de recherche des spécimens coralliens et permet le plus grand nombre possible d'analyses en aval. Les conclusions de cet atelier viennent de faire l'objet d'un artcile paru dans la revue PeerJ en accès libre.
Publication :
Vega Thurber R., Schmeltzer E.R., Grottoli A.G., van Woesik R., Toonen R.J., Warner M., Dobson K.L., McLachlan R.H., Barott K., Barshis D.J., Baumann J., Chapron L., Combosch D.J., Correa A., DeCarlo T.M., Hagedorn M., Hédouin L., Hoadley K., Felis T., Ferrier-Pagès C., Kenkel C., Kuffner I.B., Matthews J., Medina M., Meyer C., Oster C., Price J., Putnam H.M., Sawall Y. Unified methods in collecting, preserving and archiving coral bleaching and restoration specimens to increase sample utility and interdisciplinary collaboration, PeerJ. DOI 10.771/peerj.14176
Pour plus d'informations, veuillez contacter :
Dr. Christine Ferrier-Pagès
Publication en Biologie Marine - Équipe Écophysiologie et Écologie
Organigramme de la conception d'un atelier sur les méthodes de collecte, de préservation et d'archivage des spécimens de blanchiment du corail. © Vega Thurber et al.., 2022.
Pictogramme décrivant une fraction des différents pipelines méthodologiques les plus couramment utilisés, en commençant par la manipulation et la collecte des spécimens de corail, en incorporant les techniques de conservation et en terminant par l'analyse en aval et le nombre de techniques possibles. © Vega Thurber et al., 2022.